Nihad Bojadžić se nalazi u pritvoru i protiv njega se vodi sudski postupak po optužnici za ratne zločine u mjestu Trusina kod Konjica, a do lišenja slobode, u oktobru 2009. godine, on je bio aktivno vojno lice u Oružanim snagama BiH. Tužilaštvo BiH je protiv njega podiglo optužnicu zbog krivičnog djela ratnog zločina, počinjenog u ljeto 1993. godine u logoru „Muzej – Bitka na Neretvi“ u Jablanici.

Optuženi Nihad Bojadžić tereti se da je, za vrijeme rata u BiH i u vrijeme oružanog sukoba između Armije RBiH i HVO-a, u svojstvu zamjenika komandanta Specijalnog odreda za posebne namjene Štaba Vrhovne komande Armije RBiH (SOPN ŠVK) „Zulfikar“, postupao protivno odredbama Ženevske konvencije o zaštiti civilnih osoba za vrijeme rata i postupanju sa ratnim zarobljenicima od 12.08.1949. godine.

Nihadu Bojadžiću se, između ostalog, stavlja na teret da je:

-      tokom mjeseca oktobra 1993. godine, u Ratnoj bolnici Jablanica, rukom istrgao infuziju iz vene pacijenta koji je bio zarobljenik, usljed čega mu je počela krvariti vena, što mu je prouzrokovalo bolove i strah. Također, on se tereti da je tokom mjeseca septembra 1993. godine, u Ratnoj bolnici Jablanica, uz prijetnju pištoljem, u dva navrata, sprečavao ljekara da drugom povrijeđenom zarobljeniku pruži medicinsku pomoć, prijeteći zarobljenom bolesniku u bolničkoj sobi i tražeći od njega novac;

-          da je tokom mjeseca juna 1993. godine, u iskopanom rovu u Komandi SOPN ŠVK „Zulfikar“ Armije RBiH u Rogića kućama u Donjoj Jablanici, zarobljenim Hrvatima naredio da se međusobno udaraju, što su oni morali činiti sve dok im nije ponestalo snage od zadobijenih fizičkih povreda;

-          da je u drugoj polovini 1993. godine u Donjoj Jablanici, ispred restorana-kuhinje za potrebe jedinice SOPN-a ŠVK "Zulfikar" Armije RBiH, postrojio zarobljene osobe hrvatske nacionalnosti, naredivši im da se ne miču dok su granate padale, a stražarima je naredio da ih drže na nišanu, čime ih je doveo u direktnu životnu opasnost;

-          da je u drugoj polovini 1993. godine u Donjoj Jablanici iz pištolja ispalio metak u jednog zarobljenog Hrvata, kojom prilikom ga je ranio u predjelu stopala, te je zadobio teške fizičke povrede;

-          da je tokom mjeseca septembra 1993. godine, iz objekta u bazi SOPN ŠVK „Zulfikar“ u Donjoj Jablanici, izveo drugog zarobljenog Hrvata i u njegovom pravcu iz pištolja ispalio više hitaca, prouzrokujući mu na ovaj način strah za život;

-          da je u drugoj polovini 1993. godine, u hodniku zarobljeničkog centra "Muzej-Bitka na Neretvi", postrojio zarobljenike među kojima je bio i jedan zarobljenik srpske nacionalnosti, kojem je rekao: „Tebi ću Srbine glavu otkinuti“.

Optuženi Nihad Bojadžić tereti se da je počinio krivično djelo ratni zločin protiv civilnog stanovništva iz člana 173. stav 1. tačka c) i ratni zločin protiv ratnih zarobljenika iz člana 175. tačka a), u vezi sa članom 180. stav 1. Krivičnog zakona BiH.

Optužnica je proslijeđena na potvrđivanje Sudu BiH.